Analytik-jena의 'SARS-CoV-2'을 이용한 응용자료는 어날리틱예나코리아(유)에서 제공하였으며 주요 내용은 다음과 같다.
Ⅰ. Introduction
Overview of the SARS-CoV-2(Coronavirus) Detection Process: 2019년 12월, 중국의 후베이성 수도인 우한에서 새로운 SARSCoV- 2(2019-nCoV 또는 코로나바이러스) 감염사건이 발생하였으며 확산과정 관찰결과, 사람 간 전염으로 바이러스가 확산할 수 있음을 확인했다. 잠복기는 2-14일로 추정되는 급성 호흡기 질환이다.
바이러스의 급속한 확산으로, 2020년 3월 초 기준 87,000건 이상의 확진자가 발생하였다. 전 세계적으로 확진자가 급속하게 증가함에 따라, WHO(세계보건기구)에서는 현 상황의 심각성을 고려하여, 공중보건 비상사태를 선언하였고 본 응용자료에서는 현재 빠르게 확산 하고 있는 코로나바이러스 감염 여부 확인을 위한 Detection work flow에 대하여 설명하고자 한다.
Complete detection workflow
•Analytik Jena virus sample preparation & detection Work flow
Ⅱ. Material & Method
1. Sample preparation
According to WHO²:
•호흡기 물질
(1 보행 가능한 환자의 Nasopharyngeal(비인두), Oropharyngeal(인두) 내 샘플 또는 심각한 호흡기 질환 환자의 호흡기 내 Bronchoalveolar lavage sample 또는 Sputum)
•혈청학 검사를 위한, 급성 환자 또는 회복기(Convalescent) 환자 샘플(혈청 샘플들은 바이러스 검사물질로 사용 가능하며, 바이러스 감염원의 Identification 확인 시 도움을 줄 수 있다.)
1 코로나바이러스 검출을 위해 두 가지 호흡기 물질 중 어떤 것을 선택하느냐에 따라 적합한 검출 방법으로 Modify하여 사용 가능.
² 2019 코로나바이러스 감염이 의심되는 환자들의 검사 진행을 위한 임시지침(Interim guidance)을 2020년 1월 17일, WHO에서 발표.
2. Nucleic acid extraction
Analytik jena는, 채취된 샘플 내 바이러스의 RNA 추출 및 Cell free body fluid(e.g. Serum, Plasma, Liquor) 내 바이러스 RNA 추출을 위한 Extraction 키트 및 추출 Platform 제공.
InnuPREP AniPath 제품라인은 박테리아와 바이러스 DNA, RNA를 동시 추출 가능. (상세정보는 테이블 참고)
3. Amplification and detection
SARS-CoV-2 검출을 위해 개발된 분석법은 WHO³ 홈페이지를 통해 확인 가능하며, 바이러스 분석 시 필요한 Real-time PCR용 Kit는 현재 판매되고 있는 Commercial kit 사용.
• Coronavirus(Strain 2019-nCoV) by Genesig / Primerdesign
• SARS-CoV-2 detection assay by TIB MOLBIO
• RIDA® GENE Novel Coronavirus 2019 RUO Tests by r-biopharm
Detection work flow 중 많은 양의 시료 Preparation에 적합한 “CyBio Felix”와 같은 Liquid Handling system 사용으로 PCR을 Pipetting set up 가능하며, 시료의 분석 시 오염으로부터 안전한 실험 환경을 위해 PCR workstations 또는 PCR cabinet내에서 분석을
권장하는데, 이러한 실험환경은 실험시 발생할 수 있는 오염요소를 최소화 시켜주고, 안전은 최대화 시켜주기 때문에 실험효율을 높여주게 된다.
그 외 분석에 필요한, 역전사효소 및 그 외 Single components들은 Analytik jena에서 이용가능하다.
Real time PCR 분석은, Analytik jena의 Real time PCR인 q TOWER3 또는 비슷한 성능의 Real time thermal cycler를 사용하여 분석이 가능하다.
* WHO(세계보건기구)에서 8일 오후 6시(CET 10:00) 기준 발표한 자료.
Analytik-jena의 'SARS-CoV-2'에 대한 궁금한 내용은 본 원고자료를 제공한 어날리틱예나코리아(유)를 통하여 확인할 수 있다.
Model Name(모델명): q TOWER³ touch
The Person in Charge(담당자): Kim Yeonhui
Maker(제조사): Analytik-jena
Country of Origin(원산지): Germany
e-mail: lssales@analytik-jena.krData Services(자료제공): Analytik-Jena Korea
<이 기사는 사이언스21 매거진 2020년 4월호에 게재 되었습니다.>
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